بر مبنای آیین‌نامه ارزیابی شرکت‌ها و موسسات دانش بنیان نوع 1 و 2، دارا بودن نمونه آزمایشگاهی و دانش فنی؛ از شروط اولیه تایید محصولات دانش‌بنیان است. در تصویب آیین‌نامه ارزیابی شرکت‌ها و موسسات دانش بنیان نوع 3 نیز مقرر شد، چنانچه شرکتی دارای محصولات اولویت‌دار دانش‌بنیان و همچنین دارای نقض در شروط مذکور باشد، می‌تواند با دارا بودن سطح فناوری و کسب بخشی از دانش فنی، به عنوان شرکت دانش بنیان نوع 3 تایید شود.

در صورتی که شرکت قبلا به‌صورت دانش‌بنیان نوع 1، 2 یا 3 تایید شده باشد، در صورتی که محصول آنها جزو محصولات اولویت‌دار بوده و مردود شده باشد، می‌تواند با مراجعه به صندوق نوآوری و شکوفایی، درخواست تسهیلات از صندوق دهد. صندوق نوآوری و شکوفایی، پس از استعلام از مرکز شرکت‌های دانش بنیان و تایید شدن محصول، از این محصولات حمایت می کند.

تولید آنزیم ها و اسیدهای آمینه با کاربرد خوراک دام، طیور و آبزیان، مرغ لاین، نژادهای برتر شیری، تولید استارتر و پروبیوتیک لبنیات، دستیابی به توانمندی فنی تولید یک آنزیم و یک مکمل نان، حمایت از تولید نهاده های زیست فناورانه کشاورزی و تولید کود از پسماندهای بیولوژیکی برخی از این محصولات هستند.